2000 präglades av omstruktureringar i flera steg. Första steget var samgåendet mellan Hemköp och D&D Dagligvaror. I nästa steg förvärvades Spar Sverige, Spar Inn Snabbgross samt 40 procent av aktiekapitalet i Spar Finland. Bolagsstämman i maj beslutade om namnändring till Axfood AB.

I april 2003 sålde Axfood sitt svenska fastighetsbestånd till Crown NorthCorp Ltd (pressmeddelande). Fastigheterna hade ett bokfört värde på cirka 500 Mkr och realisationsvinsten var 110 Mkr.

I september 2005 tecknade Axfood ett avtal med finska SOK om försäljning av hela Axfoods innehav i Spar Finland Abp. Förvärvet slutfördes i januari 2006 (pressmeddelande, pressmeddelande).

I december 2007 tecknade Axfood avtal om att förvärva den familjeägda dagligvarukedjan PrisXtra, som omfattade sex butiker och en e-handelsverksamhet (Netxtra). Förvärvet slutfördes i januari 2008 (pressmeddelande, pressmeddelande).

För att öka närvaron i Stockholm förvärvade Axfood under 2010 Reitans färskvarudistribunal i Kungens Kurva. Verksamheten togs över i oktober (pressmeddelande).

Under 2011 förvärvade Axfood 50 procent av grossistföretaget Hall Miba AB, en leverantör av bilvårdsartiklar och biltillbehör till bensinstationer och detaljhandel (pressmeddelande).

Under 2009 inleddes ett samarbete mellan Vi-handlarna och Axfood. Som en fortsättning på detta beslutade Vi-föreningen under 2011 att de enskilda handlarna skulle teckna kedjeavtal med Hemköp, vilket resulterade i att 43 Vi-butiker i främst Stockholmsområdet konverterades till Hemköp franchise (pressmeddelande).

Under 2012 avyttrade Axfood sin e-handel för konsumenter, Netxtra, till Mathem (pressmeddelande). Samtidigt tecknades ett leveransavtal för Mathems e-handelsverksamhet i Stockholm.

I februari 2014 investerade Axfood i en ägarandel på 50 procent i den Stockholmsbaserade restaurangkedjan Urban Deli (pressmeddelande). Ägarandelen utökades till drygt 90 procent under 2018 (pressmeddelande).

Under 2017 stärkte och breddade Axfood sin portfölj genom en rad förvärv.

Förvärven av Mat.se (pressmeddelande) och Middagsfrid (pressmeddelande) ökade koncernens närvaro inom e-handeln; genom Eurocash tog koncernen en stark position inom gränshandeln mot Norge (pressmeddelande); och genom Sabas lagerverksamhet ökades effektiviteten i varuflödet (pressmeddelande). Under året investerade Axfood även i uppstarten av ett nytt nätapotek, Apohem (pressmeddelande).

Under 2019 blev Östenssonskedjans nio butiker franchisebutiker inom Hemköp (pressmeddelande).

I oktober 2021 förvärvade Axfood, efter godkännande från Konkurrensverket, partihandelsverksamheten Bergendahl Food AB samt en minoritetsandel i City Gross Sverige AB som en del av ett strategiskt partnerskap (pressmeddelande, pressmeddelande, presentation av transaktion, webbsändning från presentation av transaktionen). Förvärvet skapar skalfördelar och synergier, och gagnar även partihandelskunder och konsumenter genom ökad effektivitet samt sortiments- och logistikförbättringar.

För att stärka koncernens position inom den renodlade e-handeln blev Axfood den näst största ägaren i Mathem, i samband med avyttringen av Mat.se till Mathem i utbyte mot nyemitterade aktier i Mathem (pressmeddelande, pressmeddelande, kort presentation). Ett strategiskt partnerskap ingicks också genom ett sjuårigt leverans- och samarbetsavtal mellan Dagab och Mathem.